La plus grande cavité s'étend sur trente mètres dans la paroi calcaire, son toit percé par une arche naturelle qui canalise la lumière du matin vers les fonds marins, huit mètres plus bas. Le phénomène est géologique : les minéraux en suspension et le sable blanc réfléchissent des longueurs d'onde comprises entre 450 et 495 nanomètres, saturant l'eau de teintes cobalt et céruléennes visibles uniquement lorsque le soleil frappe sous des angles obliques entre mai et septembre.
Les pêcheurs du village adjacent de Wied iż-Żurrieq pilotent des dghajsas en bois dans ces grottes depuis le début des années 1900, une tradition officialisée lorsque Malte a ouvert ses premières excursions organisées en bateau en 1952. Le site a attiré l'attention internationale en 1973 lorsque l'équipe de tournage du documentaire de Jacques Cousteau a filmé à l'intérieur de la chambre principale, révélant des colonies de poulpes et des espèces d'algues endémiques prospérant dans la lumière filtrée. Aujourd'hui, la Blue Grotto attire plus de deux cent mille visiteurs par an, ce qui en fait le troisième site naturel le plus visité de l'archipel maltais après Dwejra et les falaises de Dingli.
À sept kilomètres à l'est, Marsaxlokk demeure le plus grand port de pêche de Malte, son port bordé de luzzus—bateaux traditionnels en bois peints en rouge, jaune et vert, chaque proue ornée de l'œil d'Osiris, un symbole phénicien adopté par les pêcheurs maltais au XVIe siècle. Le village s'est développé autour d'une crique naturelle utilisée par les commerçants phéniciens en 900 av. J.-C., plus tard fortifiée par les Chevaliers de Saint-Jean après le Grand Siège de 1565. Les marchés aux poissons du dimanche y fonctionnent depuis 1863, lorsque le gouvernement colonial britannique a désigné Marsaxlokk comme plaque tournante réglementée de la vente en gros pour la côte sud.
L'excursion d'une demi-journée à la Blue Grotto et à Marsaxlokk depuis La Valette relie ces deux sites par un circuit de quarante-cinq kilomètres, commençant généralement au point de vue de la falaise de Qrendi avant de descendre vers l'embarcadère à Wied iż-Żurrieq. Les voyagistes alternent les heures de départ pour s'aligner sur les fenêtres de marée, garantissant que les bateaux peuvent naviguer à travers les bouches des grottes pendant la période d'ensoleillement optimale de 09:00 à 12:00. De la grotte, les itinéraires se poursuivent via Birżebbuġa jusqu'à Marsaxlokk, où les guides prévoient quatre-vingt-dix minutes pour le marché du front de port et l'église paroissiale de Notre-Dame de Pompéi, construite en 1897. L'itinéraire guidé de Malte incluant Marsaxlokk, la Blue Grotto et Qrendi se termine par un arrêt sur la falaise à Delimara Point, où, si la visibilité le permet, Gozo et Comino apparaissent à trente kilomètres au nord à travers le canal.
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